В 1933 году, на базе небольшой агробиостанции города Новосибирска, сформировалась Западно-сибирская Краевая детская техническая и сельскохозяйственная станция (КДТСХС). Именно здесь появился первый зоосад. Его научным руководителем стал зоолог - писатель Максим Дмитриевич Зверев. К 1937 году в зоосаде содержалось 50 видов птиц и 35 видов зверей.

Во время Великой Отечественной Войны в 1942 году для животных, эвакуируемых из цирков и передвижных зоопарков, в городе была создана зообаза Госциркобъединения на территории автобазы. Условия содержания были плохими. Теснота, холод, плохо оборудованные вольеры, но этот импровизированный зоопарк сразу завоевал популярность среди населения. Даже в такие тяжёлые годы люди шли посмотреть на животных.

В декабре 1957 года в зоопарке возник пожар. К счастью всех животных успели спасти. Восстановление зоопарка потребовало больших усилий. Во избежание повторения трагедии деревянные вольеры были заменены металлическими. Восстановлением зоопарка занимался весь город. Не было ни одного предприятия, которое бы не включилось в эту работу. В том же году появились первые экзотические виды - волнистые попугайчики (очень редкие в то время).

В 1960 году в коллекции зоопарка содержалось 104 вида, 326 экземпляров.

Все годы существования зоопарка велась большая коллекционная работа. В результате грандиозной переписки, различных поездок внутри страны и за рубеж, переговоров, прямых обменов руководству зоопарка удалось собрать одну из самых богатых и уникальных коллекций в стране.

В настоящее время в Новосибирском зоопарке содержится около 10 000 особей, 756 видов животных. Более 350 видов занесены в Международную Красную Книгу, Красную Книгу России и Новосибирской области. На 77 видов ведутся международные племенные книги. Коллектив зоопарка участвует в 67 международных программах по сохранению редких и исчезающих видов животных.

В Новосибирском зоопарке собрана одна из лучших в мире коллекций представителей семейства кошачьих и куницеобразных. Зоопарк является членом трех международных союзов

  • EAZA (Европейская Ассоциация Зоопарков и Аквариумов);
  • ЕАРАЗА (Европейско-Азиатская Региональная Ассоциация Зоопарков и Аквариумов); 
  • WAZA (Международная Ассоциация Зоопарков и аквариумов). Участвует в международной компьютерной программе ISIS.

Благодаря усилиям коллектива зоопарка ведется огромная научная работа по спасению редких видов животных нашей планеты. Потомство некоторых редких видов впервые в мировой зоологической практике получено в Новосибирском зоопарке - речная выдра, перевязка, азиатская дикуша, камчатский снежный баран, путоранский баран и другие. Всего Новосибирский зоопарк контактирует более чем со 150 зоопарками, 44 стран мира.

С 1989 года произведено более 100 обменов животными с зарубежными партнерами 25 стран мира.

В 2006 году две речные выдры, были переданы в Нидерланды для выпуска в природу; в 2007 году птенец черного грифа, рожденный в Новосибирском зоопарке, передан в Бельгию для программы сохранения и восстановления Европейской популяции в природе.

Ежегодно зоопарк посещает более 1 500 000 человек, в том числе более 600 000 – бесплатные посещения.

Поездки в которых можно увидеть это место: